Mùi phân chủ yếu liên quan đến các quá trình khử hoạt tính ảnh hưởng đến các axit amin thoát khỏi sự hấp thụ của ruột. Những chất dinh dưỡng này trên thực tế bị chặn bởi vi khuẩn ruột kết, trải qua quá trình khử carboxyl tạo ra các amin độc hại sau:
arginine → agmatin
cystine và cystein → mercaptan
histidine → histamine
lysine → cadaverine
ornithine → putrescine
tyrosine → tiratina
tryptophan → indole và hộp
Nhiều chất trong số này tạo cho phân có mùi đặc biệt khó chịu.
Tiêu chảy và phân của người ăn chay rất kém.
Phân của cá hoặc tinh trùng là đặc trưng của bệnh lỵ trực khuẩn, bệnh tả và nói chung là bệnh lậu.
Tóm lại, mùi phân do đó bị ảnh hưởng bởi thói quen ăn uống (số lượng protein, thực phẩm thơm như tỏi hoặc hành, v.v.), bởi hệ vi khuẩn đường ruột, bởi tình trạng sức khỏe và thói quen đặc biệt (như hút thuốc hoặc nhai thuốc lá). . Nói chung, việc tiêu thụ các bữa ăn nhỏ và cân bằng, không liên quan đến số lượng thực phẩm quan trọng "không tương thích" (xem chế độ ăn uống phân tách), giúp tối ưu hóa các quá trình tiêu hóa, giảm tỷ lệ mắc các rối loạn như khí tượng và đầy hơi, và cho phân mùi sui tướng.
Cần phải được chăm sóc y tế mọi trường hợp trong đó mùi hôi của phân đi kèm với các triệu chứng như phân đen, catramose hoặc phân nhạt, có máu trong đó, sốt, ớn lạnh, chuột rút mạnh ở bụng, có nhiều chất nhầy trong phân và giảm cân.