Chẩn đoán sốt vàng không đơn giản, vì hình ảnh lâm sàng có thể có triệu chứng khó phân biệt với sốt xuất huyết do virus khác, sốt rét, sốt thương hàn, bệnh leptospirosis, sốt xuất huyết và viêm gan.
Do đó, sốt vàng nên được nghi ngờ ở những bệnh nhân ở vùng lưu hành bị sốt đột ngột với nhịp tim chậm và vàng da. Các xét nghiệm trong phòng thí nghiệm được thực hiện ngay lập tức trong một bệnh viện đủ điều kiện sẽ cho phép xác nhận hoặc loại trừ chẩn đoán.
Các khảo sát hữu ích cho mục đích này bao gồm công thức máu, xét nghiệm nước tiểu, xét nghiệm chức năng gan, nuôi cấy tế bào và sao chép retro với phản ứng chuỗi polymerase (RT-PCR). Xác nhận chẩn đoán được cung cấp bởi sự hiện diện của các kháng thể cụ thể được phát hiện bằng các xét nghiệm huyết thanh học, chẳng hạn như ELISA (xét nghiệm miễn dịch hấp thụ liên quan đến enzyme).
